La rotura del puente podrá originar fenómenos de amplificación génica a lo largo de múltiples generaciones celulares.
[2] Investigaciones recientes apuntan a que la rotura de los puentes cromosómicos, al menos de aquellos detectables mediante tinción, no ocurre frecuentemente durante la mitosis o citocinesis sino que esta estructura suele persistir durante muchas horas en la interfase.
La disrupción de la envoltura nuclear permitiría la entrada de TREX1 al núcleo y la rotura simultánea del puente y la fragmentación del ADN del puente para generar la cromotripsis.
Sin embargo, se han descrito puentes cromosómicos finos cuya existencia solo puede detectarse mediante técnicas de marcaje inmunofluorescente de las proteínas que se unen a estas estructuras.
[5][6] Se han desarrollado algoritmos que facilitan la interpretación de los patrones generados por los ciclos de ruptura-fusión-puente.