Hubo también en él una zona dedicada a seminario mayor de la Orden escolapia.
En 1838, con motivo de la Primera guerra carlista, se cierra parte del colegio —la enseñanza superior— y los PP.
Escolapios, profesores de estos cursos son trasladados a Santander con cuya ayuda se pone en marcha el citado Instituto.
Más tarde -acabado el peligro de las guerras carlistas- volverán a su sitio.
Actualmente, con la Educación Secundaria, atiende a un numeroso grupo de alumnos, que gracias a la atención constante de los profesores y educadores extraescolares pueden superar con éxito su formación académica elemental y así obtener el necesario título del Graduado Escolar.