Micranthocereus goebelianus crece erguida, columnar, raramente ramificadoa cerca de la base.
La primera descripción de esta especie fue como Cereus goebelianus, publicada en 1923 por el botánico alemán Friedrich Karl Johann Vaupel en la revista científica Zeitschrift für Sukkulentenkunde 1: 58.
[2] Posteriormente, el botánico francés Joël Lodé colocó la especie en el género Micranthocereus, pasando a llamarse Micranthocereus goebelianus y anotando estos cambios en la revista científica Cactus-Aventures International [Almería] 34: 89 ( 2022).
[3] Micranthocereus: nombre genérico que deriva de las palabras griegas: "μικρός" micra = "pequeño", ἅνθος antha = "flor" y Cereus = un género de las cactáceas.
goebelianus: epíteto otorgado en honor del botánico Karl Immanuel Eberhard Goebel.