A pesar de que sus subgrupos no son tan exitosos comercialmente como el grupo principal, generan nuevas observaciones y críticas.
Los siguientes, excepto el álbum debut del grupo SuperJunior05 (Twins) y su colaboración con TVXQ en la canción "Show Me Your Love" que fueron lanzadas bajo el nombre de Super Junior 05, son lanzamientos musicales acreditados bajo el nombre de Super Junior.
Establecido en febrero del 2007, está integrado por Leeteuk, Heechul, Kang-in, Shindong, Sungmin y Eunhyuk.
Formado en abril del 2008 e integrado por Sungmin, Eunhyuk, Donghae, Siwon, Ryeowook, Kyuhyun, y dos miembros que no pertenecen a Super Junior, Henry y Zhou Mi.
Formado en junio del 2008 e integrado por Leeteuk, Yesung, Kang-in, Shindong, Sungmin, y Eunhyuk.