[1][2] Shonin fue seleccionado como cosmonauta en 1960 y se retiró en 1979 por razones médicas.
En un principio, al igual que ocurrió con varios de sus colegas cosmonautas, se le tuvo en cuenta para participar en la misión Vosjod 3, pero por diversas razones nunca se llevó a cabo.
[2] Shonin tuvo que esperar hasta octubre de 1969 para realizar su primer –y único– vuelo al espacio como comandante de la Soyuz 6, donde participó en el primer vuelo conjunto de tres naves espaciales tripuladas, junto con la Soyuz 7 y la Soyuz 8.
[1] La duración del vuelo fue de 4 días, 22 horas y 42 minutos.
[1][2] Posteriormente, fue nombrado director del Departamento NII-30 en el Instituto Central de Investigación Científica del Ministerio de Defensa soviético.