Ha participado en 13 ocasiones en el Rally Dakar, siendo su mejor clasificación el 4.º puesto logrado en las ediciones de 2001 y 2005.
En 2006 mantuvo una estrecha lucha por el liderato con el también español Marc Coma, teniendo ambos más de 21 minutos de ventaja respecto al tercer clasificado, pero a cuatro días de finalizar el rally, se vio obligado a abandonar tras sufrir una caída en una etapa.
[5] Esteve, junto a su copiloto Eric Auge Medina, terminó su primera experiencia en coche en el Dakar en la posición número 71.
[6] En noviembre de 2011 presenta oficialmente la “Fundació Isidre Esteve”, con el objetivo de ayudar a las personas con discapacidad a reinsertarse en la sociedad y tener una vida digna.
En el Rally Dakar de 2020 se ve obligado a abandonar en la 8a etapa tras prohibirle la organización salir por aspectos del reglamento.