La Liguilla Pre-Sudamericana 2003 fue la 2.ª versión de la Liguilla Pre-Sudamericana, torneo clasificatorio para Copa Sudamericana organizado por la Asociación Nacional de Fútbol Profesional.
Participaron equipos de la Primera División de Chile y la Primera B.
Los ganadores de esta edición en calidad de invictos fueron Universidad Católica y Provincial Osorno, que derrotaron a Deportes Antofagasta y Palestino, respectivamente, en la llave final.
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