En Pumas recibió muchas oportunidades, Hugo lo mantuvo en el primer equipo durante varios torneos, sin embargo, Luis Ignacio no alcanzaba a retomar su nivel.
Para el Apertura 2005 Pumas ya no pudo sostenerlo más y es transferido al San Luis FC.
Se convierte en un jugador de relevo para partidos específicos.
Campeón de Liga con la UNAM en el torneo Clausura 2004 y en el Apertura 2004 con San Luis FC en la Primera A.
En 2008 es transferido al club Petroleros de Salamanca, con quienes estaría hasta 2009, año en el que se retira como jugador profesional.