Jones se educa en Grinnell, Iowa, y después con su familia se mudan al oeste, en 1865.
Se gradúa en el "Grinnell College" en 1875.
Recolecta flora en Iowa por dos años, y luego lo hace en Colorado, en 1878, obteniendo gran volumen de especímenes que venderá en "sets", donde colocaba representantes de muchas especies como fuese posible.
Era una práctica, típica de la época, obligando a los botánicos a sostenerse por sí en el campo, sin benefactores ni fundaciones o agencias gubernamentales que pagasen tales actividades.
Su herbario contenía colecciones pioneras de la flora de Utah, y su biblioteca, con sus notas de campo y correspondencia, residen en el Rancho Santa Ana Botanic Garden en Claremont.