El acervo de este museo está conformado principalmente por objetos de barro, como vasos, platos, ollas, artículos ornamentales e instrumentos musicales entre los que se encuentran silbatos, ocarinas, sonajas y flautas de diversas formas, que fueron elaboradas por los artesanos mayas que habitaron el territorio del municipio de Jonuta, quienes representaron en las imágenes a hombres, mujeres, niños, animales, seres fantásticos, dioses y chamanes.
También se exhiben vasijas esgrafiadas y estelas de piedra, así como objetos ornamentales en hueso y concha.
[2] Completan la colección del museo, piezas de la intervención francesa ocurrida en el municipio entre 1863 y 1866, la revolución y utensilios del siglo XIX y principios del XX El Museo Arqueológico de Jonuta, se encuentra ubicado en la calle Benito Juárez, esquina Nicolás Bravo s/n, colonia Centro, en la ciudad de Jonuta, Tabasco, a 145 km de la ciudad de Villahermosa, la capital del estado.
Para llegar desde la ciudad de Villahermosa, se puede tomar la carretera federal No.
186 Villahermosa - Escárcega, hasta el km 101 en donde se localiza el entronque de la carrera hacia la ciudad de Jonuta, a la que se llega después de 44 km .