Sus logros no pasaron desapercibidos para el veterano defensor del FCB y jugador nacional Murat Yakin, que asumió el cargo de entrenador del FC Thun en 2009.
El defensor firmó un contrato de dos años con Thun, que entonces jugaba en la segunda liga suiza más alta, hasta 2011.
Durante los primeros partidos de la temporada 2010-2011, Schindelholz reforzó al Thun Sub-21, que había ascendido a 1.ª división en 2010.
Stefan Schindelholz asumió el cargo de entrenador en el SC Dornach en 1984, dirigió al equipo desde la 4.ª liga hasta la 1.ª liga; también entrenó a los juniors y fue presidente y director deportivo del SC Dornach.
Aunque Nicolas jugó ocasionalmente en la sub-21 del FC Thun en el 2.º grupo de la 1.ª división, no hubo un encuentro directo entre los dos hermanos.