La Concertación en todas sus elecciones presidenciales designó un candidato oficial único, el cual fue elegido mediante elecciones primarias (salvo en la elección de 1989 donde Patricio Aylwin fue elegido por consenso), que por lo general se realizaron entre un representante del Partido Demócrata Cristiano (PDC), y uno del «ala progresista» del conglomerado (PS-PPD-PR).
Así, en las elecciones anteriores, los candidatos a primarias fueron: Ya desde los inicios del gobierno de Michelle Bachelet se perfilaron los primeros candidatos del oficialismo para las elecciones de 2009, destacando la senadora y precandidata presidencial en 2005, Soledad Alvear, el secretario general de la OEA José Miguel Insulza y el expresidente Ricardo Lagos.
[10] Sin embargo, en noviembre de 2008, se enfrentó a la senadora Soledad Alvear en la elección interna para la determinación del precandidato democristiano, resultando vencedor y siendo proclamado candidato oficial de su partido.
Dos meses después, fue también proclamado por los partidos Socialista (posterior a la dimisión del precandidato Insulza) y Por la Democracia.
[4] La campaña comenzó a distintos tiempos, ya que Gómez comenzó a recorrer las comunas de O'Higgins y el Maule en febrero de 2009,[4] fecha en que Frei realizaba una gira por España, donde se entrevistó con el Rey Juan Carlos I, el ministro de Economía y Hacienda, Pedro Solbes, y el presidente del Partido Popular, Mariano Rajoy.
[13] Frei inició formalmente su campaña el 1 de marzo en Talca, acompañado por los presidentes de los partidos que lo respaldaban, Juan Carlos Latorre (PDC), Pepe Auth (PPD) y Camilo Escalona (PS).
Fue conducido por Montserrat Álvarez, y las preguntas a los candidatos estuvieron a cargo de los periodistas Rodrigo Siderakis (por TVN Red O'Higgins) y Esteban Sáez (por TVN Red Maule).
Desde ese entonces, Frei, apoyado por los tres partidos mayoritarios de la Concertación, lideró las encuestas, superando por más del 20 % a su contendor.
Sin embargo, hacia las 20:00 horas, varios personeros de la coalición afirmaban que Frei ganaba por más del 20 %, gracias al mayor apoyo que había tenido el demócrata cristiano en comunas más pequeñas, con mayor población rural.
[36] El altercado fue difundido por todos los medios de prensa, y generó numerosas críticas a Escalona, quien debió pedir disculpas por lo sucedido.
[37] El proceso fue ampliamente criticado por los partidos que no pertenecen a la Concertación, siendo calificado incluso como un "fracaso".
[38] Ello se suma a la baja participación que hubo en contraste a las primarias anteriores;[39] en la elección primaria de 2009 votó (en las regiones del Maule y O'Higgins) el 36,34 % de quienes participaron en el mismo proceso del año 1999 (donde se enfrentaron Ricardo Lagos y Andrés Zaldívar), lo que reflejaría un desgaste de la Concertación, y en general, de todo el espectro político.
[40] El diputado socialista Marco Enríquez-Ominami inició en enero de 2009 una precandidatura presidencial propia,[41] que no fue respaldada por su partido, ya que éste ya había comprometido su apoyo a Eduardo Frei.