En el año 2000 tenía una población de 16.432 habitantes y una densidad poblacional de 137.5 personas por km².
Prunedale se encuentra ubicado en las coordenadas 36°46′33″N 121°40′11″O / 36.77583, -121.66972.
Según la Oficina del Censo, la ciudad tiene un área total de 119,5 km² (46,1 mi²), de la cual 119,4 km² (46,1 mi²) es tierra y 0 km² (0 mi²) 0.00% es agua.
Los hombres tenían unos ingresos medios de $48,863 frente a los $34,542 para las mujeres.
La renta per cápita para la localidad era de $24,318.