Hay aproximadamente 40.000 lagos en la cuenca del Yana, incluidos tanto lagos alpinos formados a partir de la glaciación en las cordillera Verkhoyansk (las tierras bajas fueron siempre demasiado secas para la glaciación) como lagos de desbordamiento en las llanuras pantanosas en el norte de la cuenca.
Toda la cuenca del Yana está bajo un permafrost continuo y la mayoría son bosques de alerce que se van convirtiendo gradualmente en tundra conforme se avanza hacia el norte, alrededor de los 70°N, aunque los árboles se extienden en microhábitats adecuados justo hasta el delta.
Los principales puertos del río Yana son Verkhoyansk, Batagay, Ust-Kuyga y Nizhneyansk.
En 1892-94, el barón Eduard Toll, líder de una expedición de la Academia Imperial Rusa de Ciencias, acompañado por Alexander von Bunge, llevó a cabo los estudios geológicos en la cuencas del río Yana (y también del río Indigirka y el río Kolyma).
[2] Durante un año y dos días, la expedición cubrió 25.000 km, de los que 4.200 fueron en ríos, llevando a cabo los estudios geodésicos.