Su padre, Julián Javier, fue segunda base de los Saint Louis Cardinals y nombró a su hijo Stan en honor a su compañero y amigo Stan Musial.
También es uno de los únicos tres jugadores en batear en contra de Terry Francona (mánager de los Medias Rojas), cuando Francona hizo una breve incursión como lanzador y el único que se ponchó con tres lanzamientos consecutivos.
Su destacada carrera incluye haber finalizado en el décimo lugar en bases robadas de la Liga Americana en 1994, con 24, y en séptimo en bases robadas de la Liga Americana en 1995, con 36.
[1] En 2011, Javier fue incluido en el Hispanic Heritage Baseball Museum Hall of Fame.
En el 2013 las Águilas Cibaeñas lo escogen como nuevo gerente general para el periodo 2013-2014.