Los grupos de investigación del SIB están localizados en Ginebra, Lausana, Zúrich, Berna, Basilea, Friburgo y Lugano.
Mantiene varias bases de datos biológicas, incluyendo Swiss-Prot.
El servidor Expasy, con mirrors en varios países alrededor del mundo, está dedicado al análisis de la secuencia proteica así como a la estructura bidimensional de estas.
El primer director del instituto fue Victor Jongeneel, quien fue seguido entre 2001 y septiembre de 2007 por Ernest Feytmans.
Desde julio de 2018, el instituto está dirigido por Christine Durinx y Ron Appel.