Algunos autores sostienen que la subespecie T. vassorii atrocoerulea se trata de una especie separada.
La especie T. vassorii fue descrita por primera vez por el ornitólogo francés Auguste Boissonneau en 1840 bajo el nombre científico Tanagra vassorii; su localidad tipo es: «Santa Fe de Bogotá, Colombia».
[8] Los amplios estudios filogenéticos recientes demuestran que la presente especie es pariente próxima de un clado integrado por Tangara nigroviridis y T. fucosa + T.
[9] Las clasificaciones Aves del Mundo (HBW) y Birdlife International (BLI) consideran a la subespecie T. vassorii atrocoerulea como una especie separada, la tangara azulinegra moteada Tangara atrocoerulea,[5] con base en significativas diferencias de plumaje.
[10][11] Según las clasificaciones del Congreso Ornitológico Internacional (IOC)[10] y Clements Checklist/eBird v.2019[11] se reconocen tres subespecies, con su correspondiente distribución geográfica:[11]