El óblast autónomo fue formado el 26 de abril de 1926 en el territorio del krai del Cáucaso Norte como resultado de la división del Óblast autónomo Karachái-Cherkeso previamente instaurado en 1922.
[1] Según la reforma del 1 de enero de 1941 la región estaba dividida administrativamente en una ciudad, Mikoyan-Shajar, y seis raiones: Zelenchukski (Zelenchukskaya), Malokarachayevski (Kislovodsk, no pertenecía en sí al raión), Mikoyanovski (Kosta Jetagurov), Pregradnenski (Pregradnaya), Ustdzhegutenski (Ust-Dzhegutinskaya) y Uchkulanski (Uchkulan).
A raíz de la deportación de los karacháis a Asia Central y Kazajistán bajo la acusación de colaboración con la Alemania Nazi.
El territorio del OA Karachái se dividió entre el krai y el óblast autónomo Cherkeso, y los raiones Mikoyanovski y Uchkulanski pasaron a formar el raión Klujorski de la República Socialista Soviética de Georgia.
En 1957 se reinstauraría el óblast autónomo Karachái-Cherkeso.