(3636) Pajdušáková es un asteroide perteneciente al cinturón de asteroides, descubierto el 17 de octubre de 1982 por Antonín Mrkos desde el Observatorio Kleť, České Budějovice, República Checa.
Designado provisionalmente como 1982 UJ2.
Fue nombrado Pajdušáková en honor a la primera mujer astrónoma eslovaca Ľudmila Pajdušáková.