(5313) Nunes es un asteroide perteneciente al cinturón de asteroides, descubierto el 18 de septiembre de 1982 por Henri Debehogne desde el Observatorio de La Silla, en Chile.
Nunes se designó inicialmente como 1982 SC2.
Más adelante fue nombrado en honor al matemático, astrónomo y geógrafo portugués Pedro Nunes (1502-1578).
[3] Nunes orbita a una distancia media del Sol de 2,2155 ua, pudiendo acercarse hasta 1,9451 ua y alejarse hasta 2,4859 ua.
Emplea en completar una órbita alrededor del Sol 1204 días.