Su fórmula estructural corresponde a la del heptano con un grupo amino unido en cada extremo.
La 1,7-heptanodiamina se presenta como trozos cristalinos blancos o amarillentos que funden a 28 °C.
Posee una densidad inferior a la del agua —ρ = 0,860 g/cm³— y es soluble en ella, en proporción de 1,8 × 102 g/L.
Es aún más soluble en disolventes como etanol, acetona, éter o benceno (logP = 0,57).
[7] Esta amina también se emplea en la preparación de 7-amino-1-guanidinooctano y 1,7-diamino-trans-hept-3-eno, utilizados como inhibidores de la desoxihipusina sintetasa, enzima que cataliza el primer paso en la biosíntesis del inusual aminoácido hipusina.