El Gobierno Vasco impulsó en 2012 la creación de este centro de investigación, en el que participan Ikerbasque;[1] y la Universidad del País Vasco (UPV/EHU) son los patronos fundadores.
El centro toma su nombre Nicolás Achucarro, médico e investigador vasco, pionero de las modernas técnicas de investigación del cerebro, a cuya figura que pretende rendir tributo con este gesto.
El objetivo científico del centro, en sus primeros años de andadura, es el estudio de la Biología Neuro-glial en el cerebro sano y enfermo; La organización y el procesamiento de la información en los circuitos neuronales; La caracterización de los mecanismos genéticos, moleculares y celulares en las enfermedades neurodegenerativas: y la investigación traslacional y desarrollo de nuevas terapias para las enfermedades cerebrales.
De manera que esa investigación fundamental contribuya a proporcionar las claves para nuevas terapias y herramientas para luchar contra las enfermedades neurodegenerativas como el Alzheimer, la Esclerosis Múltiple, entre otras.
En septiembre de 2013, la Comisión Europea reconoce[5] al centro Achucarro con el galardón "HR Excellence in Research[6]" que otorga a las organizaciones dedicadas a la investigación que gestionan de manera excelente a y con sus personas.