Ante la necesidad de que la isla tuviera un aeropuerto operativo, en 1962 se inician los estudios para localizar el mejor lugar donde ubicarlo, pero la orografía de la isla no ofrece muchos lugares aceptables para esta función.
El avión que oficialmente inauguró el aeropuerto fue un DC-3 militar, en el que iba el ministro Julio Salvador y Díaz-Benjumea, aunque unos días antes, una avioneta Dornier Do-27 del ejército del aire había tomado tierra también en la isla.
En julio de 1992, la ruta Tenerife Norte-El Hierro pasa a ser gestionada por la compañía Binter Canarias que emplea aviones ATR-72, por lo que se hace necesario aumentar la longitud de la pista hasta los 1205 metros.
En ella desarrollan su trabajo el controlador aéreo y los técnicos de mantenimiento.
Climograma del aeropuerto de El Hierro: clima desértico ("BWh)".