[2] El aeropuerto sirve como base de operaciones para la aerolínea guatemalteca Aéreo Ruta Maya que opera vuelos diarios al Aeropuerto Internacional La Aurora y al Aeropuerto Internacional de Occidente.
Antes de esas mejoras el aeropuerto servía principalmente para carga y vuelos chárter de emergencia, pero luego de la ampliación y de convertirse en base secundaria de la aerolínea guatemalteca Aéreo Ruta Maya los vuelos fueron incrementado durante los últimos años, reportando en 2023 un total de 20,463 pasajeros comerciales siendo su principal ruta hacia el Aeropuerto Internacional La Aurora en la Ciudad de Guatemala.
[3] El Aeropuerto de Huehuetenango opera principalmente vuelos nacionales, con conexiones a la Ciudad de Guatemala y otros destinos importantes dentro del país.
Las aerolíneas que operan en el aeropuerto incluyen tanto compañías nacionales como chárter regionales, que ofrecen una variedad de horarios y servicios para los viajeros.
Otras aerolíneas que operan vuelos chárter son: Los aeropuertos más cercanos son: