Sus ideas serían en gran parte ignoradas y olvidadas, solo para ser readoptadas como la base de los sistemas penales modernos más de un siglo más tarde, a mediados y finales del siglo XX.
A la edad de nueve años, su padre murió y fue criado por Allan Maconochie, más tarde Lord Meadowbank.
Se unió a la Royal Navy en 1803 y como guardiamarina estuvo en servicio activo en las Guerras Napoleónicas, ascendiendo al rango de Teniente.
En la paz que siguió a la derrota final de Napoleón, Maconochie pasó 13 años en Edimburgo estudiando geografía y geopolítica.
En 1828 se trasladó a Londres, Inglaterra, donde fue fundador y primer secretario de la Royal Geographical Society en 1830.
Maconochie regresó al Reino Unido en 1844 y dos años más tarde publicó un libro que describe su sistema.