En 1985 un grupo de dirigentes liberales progresistas del Partido Liberal en el departamento del Tolima, encabezados por Guillermo Alfonso Jaramillo (futuro Gobernador y senador) le propone a Gómez Méndez ser su candidato para la Cámara de Representantes como alternativa.
Entre 1989 y 1990 fue procurador general de la Nación, afrontando el recrudecimiento del narcotráfico (su antecesor Carlos Mauro Hoyos había sido asesinado).
En 2005 lanzó su precandidatura a la Presidencia de la República, pero declinó en el marco del Congreso Nacional Liberal ese mismo año.
Desde 2003 es el Secretario Internacional del Partido Liberal y en 2008 fue elegido como Vicepresidente de la Internacional Socialista durante su XXIII Congreso en Atenas, Grecia, en sustitución de Horacio Serpa.
En la consulta interna liberal realizada el 27 de septiembre de 2009 obtuvo 195.867 votos, los cuales no fueron suficientes para ser elegido candidato único del Partido Liberal, siendo superado por Rafael Pardo.