De padre español y madre boliviana, Morales inició su carrera en los clubes amateur Atlético Llano y Coquimbo Sporting.
[2][3] Aparte del fútbol, practicó hockey sobre patines, baloncesto y waterpolo, siendo convocado a la selección de Chile para el Nacional de Valparaíso de 1958.
[1] Morales jugó tanto en Coquimbo Unido como en Deportes La Serena, ambos archirrivales, siendo considerado una leyenda en el club aurinegro.
Junto al equipo pirata consiguió el ascenso a Primera División, tras consagrarse campeones de la Segunda División 1962,[4] permaneciendo en Coquimbo Unido hasta 1966.
En 1967 pasó a Deportes La Serena, permaneciendo en el club hasta 1970.