Participa en varios de los consorcios internacionales más importantes relacionados con el estudio del cáncer.
Es también Editor Ejecutivo de la principal publicación del sector (Bioinformatics OUP).
[6] En 1987 fue científico visitante en el laboratorio de la Cruz Roja Americana.
Todos estos activos convergen en el tema general de la medicina personalizada, con especial interés en la interfaz con la inteligencia artificial y la informática de alto rendimiento.
Valencia ha publicado más de 420 artículos científicos revisados por pares,[5][14] ampliamente citados[6] (índice h 2021 de 118)[15] en revistas científicas que incluyen, entre muchas otras, Nature,[16][17][18] PNAS[8] o PLOS Computational Biology.