[1] Andoni inició su trayectoria en los banquillos dirigiendo a los equipos juveniles de San Jorge y Oberena en los que estuvo durante 5 años en fútbol base formativo.
En 2014, dirige al Rotxapea CD de liga regional con el que lograría el ascenso a Territorial Preferente y en el que permanecería durante otra temporada más.
En la siguiente campaña, disputó la Copa del Rey y volvió a alcanzar la fase de ascenso a la Segunda División B de España, quedando en tercera posición pero no logró el ascenso.
En la temporada 2019-20, tras volver a quedar en primera posición del grupo navarro, si logró el ascenso a la Segunda División B de España.
En las temporadas 2020-21 y 2021-22, lograría mantener a la Unión Deportiva Mutilvera, tanto en la Segunda División B de España como en la Segunda Federación, respectivamente.