A partir de entonces, colaboró regularmente en el suplemento dominical del diario, así como en numerosas revistas y periódicos argentinos y extranjeros.
Agüero fue arrestado, estuvo dos meses en la cárcel, y seis meses con arresto domiciliario en la casa que habitaba en ese momento, que había pertenecido a su abuelo materno, en la entrada de la villa serrana de Merlo.
En 1949 y 1950, la Comisión Nacional de Cultura le otorgó una Beca para realizar Estudios e Investigaciones sobre la vida y la obra de Leopoldo Lugones.
Entre sus principales publicaciones se destacan: «Poemas lugareños» (1937), «Romancero Aldeano» (1938), «Pastorales» (1939), »Romancero de niños» (1946), «Cantatas del árbol» (1953), «Un hombre dice a su pequeño país» (1972), «Canciones para la voz humana» (1973) y «Poemas Inéditos» (1978).
Estas tres últimas obras fueron publicadas póstumamente por su segunda esposa: Rosa Romanella de Agüero.