La organización responsable de la raza es la AraAppaloosa and Foundation Breeders' International (AAFB).
Los caballos Appaloosa originales, tal como los criaban los Nez percé y antes de recibir el nombre actual, eran caballos con un tipo muy característico y refinado.
El fundador del registro Appaloosa, Claude Thompson, empleó los caballos árabes para mejorar algunos detalles de la cabaña inicial formada a partir de caballos recuperados.
Los descendientes formaron la línea de los caballos Appaloosa "fundadores".
La asociación AAFB considera que la raza AraAppaloosa es un intento de preservar o recrear los tipos de caballos criados por Nez percé en los siglos XVIII y XIX.