El patrimonio documental que conserva está conformado por seis fondos documentales, la colección especial Esperanza Iris y la Planoteca del AHCDMX.
Estos grupos documentales en su conjunto corresponden a un periodo que abarca desde 1524 y hasta el año 2000.
El Palacio de los condes de Heras y Soto, considerado por investigadores como Manuel Toussaint como una singular joya arquitectónica,[5] era para 1933 una bodega.
[8] La conformación del archivo inició en 1524, con el establecimiento del gobierno local de la nueva capital de la Nueva España.
[3] El archivo se divide en distintos cuerpos documentales divididos en seis Fondos y una colección especiales: Fondos Colección especial