La AIL está particularmente preocupada por los problemas derivados del uso del agua y pretende fomentar y contribuir a la difusión también de los estudios científicos de carácter aplicado, relacionados con la gestión y conservación de los ecosistemas acuáticos continentales.
En 2002 la AEL pasó a Asociación Ibérica de Limnologia (AIL).
Sus finalidades son fomentar y dar a conocer los estudios limnológicos en el espacio Ibérico.
La asociación publica la revista Limnetica, indexada por la Web Of Knowledge (WOK) de lThomson Reuters.
La asociación tiene una página web donde relaciona los eventos de interés sobre la Limnología Ibérica de interés global para socios y simpatizantes.