Juega actualmente en el Campeonato Paulista A3.
Entre 1969 y 1977, el equipo ganó siete veces el torneo.
Los buenos resultados llevaran la dirección del club a profesionalizar el club.
En el año de 2003, el Flamengo de Guarulhos viajó para el Líbano, donde realizó un amistoso contra el Nejmeh, donde los de Guarulhos ganaron por 3 a 0.
El jugador Bebeto, campeón del mundo en 1994, jugó un tiempo en cada equipo.