[2] Desde el seno sureste de la bahía hasta la extremidad norte de la punta San Nicolás, se desprendía una isla que hoy se encuentra unida a tierra firme por un terraplén artificial.
Entre las aves marinas presentes en la bahía podemos citar a tres especies de aves guaneras: el cormorán guanay (Phalacrocorax bougainvillii), el pelícano peruano (Pelecanus thagus) y el piquero peruano (Sula variegata), además del pingüino de Humboldt (Spheniscus humboldti) y la chuita (Phalacrocorax gaimardi),[4] especies que se encuentran categorizadas por la legislación peruana como en peligro de extinción.
[5] Otras especies de aves presentes en la zona marino-costera de la bahía son el cormorán neotropical (Phalacrocorax brasilianus), el ostrero negro (Haematopus ater), el zarcillo (Larosterna inca), el zarapito trinador (Numenius phaeopus), la gaviota peruana (Larus belcheri), la gaviota dominicana (Larus dominicanus), la gaviota gris (Larus modestus), el churrete marisquero (Cinclodes taczanowskii), el vuelve piedras (Arenaria interpres), el gallinazo cabeza roja (Cathartes aura), la garza blanca pequeña (Egretta thula) y la dormilona oscura (Muscisaxicola macloviana), esta última ave es una especie migratoria que viene desde el sur de Chile y Argentina a pasar el invierno en las costas peruanas.
[4] Esta bahía también se destaca por contener grandes biomasas de concha navaja (Ensis macha).
[4] La diversidad marina presente da soporte a la pesca artesanal que se realiza a lo largo de todo su litoral y que captura anchoveta (Engraulis ringens), pejerrey (Odontethes regia regia), lorna (Sciaena deliciosa), cabinza (Isacia conceptionis), camotillo (Normanichthys crockeri), bagre (Galeichthys peruvianus), entre otras.