Los colores de la bandera representan la historia de Madagascar, su anhelo de independencia y sus clases tradicionales.
El rojo y el blanco eran los colores del Reino de Merina, que sucumbió ante Francia en 1896.
[2] Eran usados en la bandera de la última monarca de Merina, la reina Ranavalona III.
Pueden indicar los orígenes étnicos del pueblo malgache en el Sudeste Asiático, y también aparecen en la bandera de Indonesia.
El verde era el color de los Hova, la clase predominante de campesinos plebeyos, que desempeñó un importante papel en la agitación contra Francia y en el movimiento de la independencia.