[2] Sólo en 1552 Domenico di Brindisi y Stefano Salinaro obtuvieron el encargo de construir una capilla para albergar el icono mariano, adornada con varias esculturas y cerrada por una puerta de hierro.
[6]Para resolver los problemas relativos a la construcción de la iglesia, se nombró una comisión especial,[6] que supervisó las obras, que duraron de 1743 a 1759, [6] y que, con la ayuda del arquitecto Mauro Manieri y del príncipe Michele Imperiali, eligió, entre todos los presentados, un proyecto de Roma.
[7] En 1759 se inauguró la nueva iglesia, aunque no completamente terminada[6] (así lo demuestra también una placa colocada en la pared derecha del presbiterio).
[9] Una vez terminado el edificio, surgió un litigio entre el Capítulo y la Universidad porque ambos reclamaban el "ius patronatus".
Durante algunos años la iglesia fue objeto de una restauración conservadora completa (cúpula, fachada, exterior e interior).
[13] La antigua iglesia, que data del período 1310-20, tenía inicialmente nueve altares,[13] cuatro a la derecha y cuatro a la izquierda en comparación con el altar mayor, dedicado a la Madonna della Fontana, detrás del cual se encontraba la cueva, rodeado de rejas de hierro, donde se encontraba el fresco bizantino descubierto por el príncipe de Tarento.
El movimiento de las pilastras, combinado con capiteles corintios, crea un efecto "plástico-pictórico", dando a la fachada un aspecto ondulado.
[14] En general, el diseño de la fachada muestra numerosas afinidades con los diversos proyectos realizados por Vignola, Borromini y Barigioni, lo que la hace más similar a las iglesias barrocas romanas que a las iglesias de las ciudades cercanas, que en cambio estaban más claramente influenciadas por el barroco de Lecce.
[9] Al interior se accede a través de tres puertas: las dos laterales, rematadas por frontones mixtilíneos, son de trazo sencillo, bordeadas por varillas, a las que se unen con una voluta rizada.
La portada central tiene una estructura más compleja y rica en elementos ornamentales: está cerrada por semipilares incorporados al muro, decorados con hojas de acanto.
El frente de los pilares está ocupado por delicadas encarpas que continúan también en los muros laterales y en el tramo del entablamento.
Esta concentración de elementos ayuda a darle mayor impulso vertical al cuerpo central.
Sobre una base, que retoma simétricamente el orden inferior, se asienta el superior, dividido en tres campos por las habituales pilastras decoradas con capiteles compuestos de referencia borrominiana.
En los lados extremos, colocadas sobre bases junto a las volutas que unen los dos órdenes, se encuentran las estatuas de los apóstoles Pedro y Pablo.
Está revestido exteriormente con azulejos de mayólica policromada, retomando la técnica decorativa napolitana.
[20] De base circular, se asienta sobre un tambor alto puntuado por dobles pilastras, presidido por ocho grandes ventanales.
[24] El modelo del altar, tanto en mármol como en materiales menos valiosos, se volverá a proponer en muchas otras iglesias.
En la antisacristía, sin embargo, hay otro valioso lienzo que representa a la Virgen del Rosario, de artista desconocido.
[26] La decoración interior de la nueva iglesia se realizó con estucos, volutas desenrolladas por ángeles, volutas rizadas, posteriormente cargadas de color y dorado para dar un significado distorsionado al gusto barroco.
[26] Después de la zona del crucero, se encuentran el altar y el lienzo, ambos dedicados a Sant'Anna, antiguamente pertenecientes al Castillo Imperial.