Al mismo tiempo los rusos habían iniciado una importante operación militar en Alkhan-Yurt, en la carretera que comunica las ciudades de Rostov del Don (Rusia) y Bakú (Azerbaiyán), que atraviesa el suroeste de la ciudad; para ello desplazaron 1.500 soldados del MVD y milicianos chechenos leales a Moscú en las proximidades de Grozni, irónicamente a la vez que los rebeldes chechenos entraban en la ciudad.
Las fuerzas chechenas que entraron en Grozni estaban formadas por 1500 hombres aproximadamente[3] (las fuentes oficiales rusas hablan de unos pocos cientos).
Sin embargo los separatistas, liderados por Aslán Masjádov, utilizaron tácticas de infiltración que resultaron muy perjudiciales para los rusos.
[11] Unos 7000 soldados rusos quedaron rodeados en diversos bastiones al interior de la capital chechena.
[12] El gobierno checheno prorruso abandono la ciudad para refugiarse en una base militar cercana.
Mientras en la primera de las dos ciudades la guarnición rusa resistió el ataque, la segunda fue ocupada sin luchar.
Numerosos chechenos fueron detenidos y ejecutados por los separatistas al considerarlos "colaboracionistas"; en Grozni se estimaron en unos 200.
La Unión Europea llamó a un inmediato cese al fuego, que fue ignorado.
Convencido de que la victoria militar era imposible con los medios a su disposición, optó por iniciar negociaciones con los separatistas chechenos.
El general Pulikovsky envió un ultimátum a los separatistas para que abandonasen Grozni en 48 horas o se les atacaría con todos los medios disponibles.
[15] Los varones mayores de 11 años fueron tratados como presuntos combatientes y no se les permitió pasar tras las líneas rusas.
El 22 de agosto los rusos aceptaron retirar todas sus fuerzas en Chechenia a sus bases en Jankala y Severny.