Se trata de un bucle rico en glicina precedido de una lámina beta y seguido por una hélice alfa.
Interactúa con los grupos fosfato de los nucleótidos y el ion Mg2+, que coordina los fosfatos β y γ.
En las GTPasas pequeñas la secuencia consenso del bucle P es GxxxxGK (S/T), que suele denominarse motivo de Walker A.
Tras una hidrólisis de nucleótidos, los bucles P no alteran significativamente su conformación, y se mantienen unidos a los restantes grupos de fosfato.
Otras proteínas con bucles P funcionales son la ATP sintasa, la miosina, la transducina y la helicasa.