Esta especie fue descrita originalmente en el año 1940 por el botánico alemán Karl Ewald Maximilian Burret bajo el nombre científico de Syagrus leptospatha.
[1] Había sido descubierta en 1936, y recién pudo encontrarse nuevos ejemplares en 1994 (58 años después), en la localidad de [[Pedro Juan Caballero]], Paraguay.
Fue recombinada por el botánico estadounidense Larry Ronald Noblick en el año 2006.
La localidad tipo es: Brasil: Mato Grosso, Boliche Seco, Campo Grande.
Butia leptospatha es un endemismo de la provincia fitogeográfica del cerrado,[2] en donde habita en suelos rojos (latéricos) no estructurados.