El Campeonato Brasileño de Serie C 2016 fue la vigésimo sexta edición (26ª) del campeonato de tercera categoría del fútbol brasileño.
La Serie C 2016 conservará el formato implementado desde la temporada 2012, es decir, que los 20 participantes serán divididos en dos grupos de 10 equipos cada uno.
Se jugarán partidos de ida y vuelta y los cuatro mejores equipos de cada zona clasificarán a la fase final.
Se jugarán cuartos de final, semifinal y final para conocer al campeón y a los cuatro ascendidos a la Campeonato Brasileño de Fútbol Serie B 2017.
Por otro lado, los dos equipos peor ubicados en cada zona descenderán a la Campeonato Brasileño de Fútbol Serie D 2017.