Siendo un jugador muy joven, debutó en el Club Atlético Nueva Chicago, y posteriormente jugó para San Telmo, Los Andes.
A partir de ahí, el argentino se hizo un hueco en el once titular, y ayudó a que Santa Fe se coronara campeón por sexta vez en su historia, siendo un jugador fundamental y el goleador del equipo con 25 goles.
Así, Pandolfi se convirtió en ídolo de hinchada santafereña y entró en la historia del equipo albirrojo.
Así, Carlos Alberto terminó de gran manera su paso por el cuadro cardenal, donde se convirtió en campeón e ídolo.
Después de su gran etapa en Independiente Santa Fe, Pandolfi regresó a Argentina, y consiguió jugar en Temperley.