Carlos Juan Amadeo de Saboya (en italiano, Carlo Giovanni Amedeo di Savoia; Turín, 23 de junio de 1489-Moncalieri, 16 de abril de 1496) fue duque de Saboya desde 1490 hasta 1496 como Carlos II.
También fue rey titular de Chipre, Jerusalén y Armenia, príncipe titular de Antioquía, y conde titular de Trípoli.
Nació en Turín, hijo del duque Carlos I de Saboya y de Blanca de Montferrato, Durante su reinado su madre, Blanca de Montferrato, actuó como regente.
El rey Carlos VIII de Francia invadió los territorios de Saboya y Piamonte en su campaña de conquista de Nápoles, y la Casa de Saboya estableció su residencia en Turín, donde permanecieron hasta la Unificación de Italia.
El duque Carlos murió en Moncalieri con seis años, cayendo de su cama, y el ducado fue heredado por Felipe II de Saboya.