Cavia intermedia

Se diferencia de las otras especies del género en razón de sus características genéticas y morfológicas, incluyendo su número cariotípico 2n = 62, el cual es diferente a las especies continentales del género citogenéticamente estudiadas, las que poseen 2n = 64.

[3]​ Esta especie posee un órgano genital femenino externo similar en tamaño y apariencia al pene del macho.

Sobre la base de evidencias morfológicas, se definió que su probable origen es un ancestro compartido con Cavia magna, el cual quedó aislado del continente hace 8000 años.

[7]​ Si bien técnicamente está protegida al haberse legislado que toda entrada de personas al archipiélago donde habita está legalmente prohibida al haber sido el mismo designado como zona de preservación dentro del parque estadual Serra do Tabuleiro (donde está insertado),[4]​ su aplicación no se hace cumplir y las personas tienen fácil acceso a la isla.

Se presume como las mayores amenazas su caza directa, y especialmente la introducción de predadores (ratas, gatos, perros, etc.).