Fundado formalmente en 1964 por el expresidente argentino Arturo Frondizi como una continuación a la labor del Centro de Investigaciones Nacionales, lo cierto es que comenzó a funcionar informalmente en 1956.
El CEN constituyó un importante espacio de difusión y debate político-cultural del desarrollismo, y ayudó a ampliar su acervo documental.
En 1995 el CEN donó su patrimonio a la Biblioteca Nacional y en 1998 dispuso su disolución.
Su director, Enrique Daniel Rodríguez Masdeu, al carecer de la estructura necesaria para la iniciación del curso lectivo, solicitó a Frondizi el ámbito del CEN.
El expresidente encomendó a los encargados del CEN que dispusieran de todos los medios necesario para hacer efectiva la solicitud.