La actividad del CISM se desarrolla en torno a cuatro ejes: Además, el CISM presta asistencia sanitaria a la comunidad, que se beneficia de la presencia de personal sanitario investigador y de los avances de las investigaciones que se desarrollan en el centro.
El CISM también contribuye a fortalecer el capital humano del país, especialmente deficitario en el ámbito de la investigación; para ello desarrolla programas de formación específicos dirigidos a investigadores mozambiqueños, que pueden promover y garantizar el esfuerzo continuado en la lucha contra las enfermedades que generan pobreza en su propio país.
La preside Pascual Mucumbi, ex primer ministro del país entre 1994 y 2004.
Gracias a esta fundación están trabajando en la creación de la vacuna contra la malaria.
Con este galardón se reconoció la contribución de estos centros al desarrollo de los países africanos, a través de tres ejes fundamentales: Los otros centros premiados son el Ifakara Health Research and Development Centre (Tanzania), el Malaria Research and Training Center (Mali), y el Kintampo Health Research Centre (Ghana), con los que el CISM mantiene una estrecha colaboración.