En su etapa amateur, Schwartzel representó a Sudáfrica en el Torneo Eisenhower 2002.
Con 18 años recién cumplidos, el golfista consiguió la tarjeta para disputar el European Tour 2003.
Por otra parte, fue tercero en el Casio World Open de Japón.
Schwartzel inició la temporada 2006 con un segundo puesto en el Campeonato Alfred Dunhill y un triunfo en el Vodacom Tour Championship.
Por tanto, se colocó octavo en la clasificación final del European Tour.