El clan Nakatomi (中臣氏 Nakatomi-uji) era un grupo de parentesco aristocrático japonés (uji).
A pesar de que sus posesiones materiales no eran las más extensas, su importancia espiritual y ritual colocó a Nakatomi e Imibe en el segundo lugar después de la Casa Imperial durante su apogeo.
Como resultado de la posición ritual y el papel de los Nakatomi en el período Asuka, se encontraban entre los principales defensores del conservadurismo en la controversia sobre la introducción del budismo en Japón en el siglo VI.
Sin embargo, en la época de Nakatomi no Kamatari, a principios del siglo VII, el clan había cambiado de bando, posiblemente como resultado de su lealtad y estrecha relación con la familia imperial; siguiendo al Príncipe Shōtoku, probablemente el defensor más famoso del budismo en toda la historia japonesa, y más tarde al Príncipe Naka-no-Ōe, el clan Nakatomi ayudó a eliminar al clan Soga, poderosos y muy activos partidarios del budismo y de la administración actual de la época (ver Incidente Isshi).
Kamatari es honrado como el fundador del clan Fujiwara, que acumuló poderes y prestigio extraordinarios en el período Heian (794-1185).