En colaboración con Karen Horney, Harry Stack Sullivan, William Silverberg y Erich Fromm formó parte de la corriente crítica conocida como «neopsicoanalítica», escuela neofreudiana o «corriente culturalista» que en 1941 fundó en Nueva York la organización Association for the Advancement of Psychoanalysis como institución independiente de la Asociación Psicoanalítica Internacional.
Trabajó en la Clínica Phipps de la Universidad Johns Hopkins, que por aquel entonces dirigía su fundador, el connotado psiquiatra y neuropatólogo suizo Adolf Meyer.
Durante su trabajo en esta clínica psiquiátrica universitaria conoció a Harry Stack Sullivan, con quien estrechó lazos de amistad profunda y colaboración duradera.
Tanto Thompson como el Zodiac Club completo, renunciaron a la sociedad «oficial» psicoanalítica y fundaron una entidad independiente: la Association for the Advancement of Psychoanalysis.
Pronto se sumaron a la nueva asociación otros críticos culturalistas del freudismo, tales como Margaret Mead y Abram Kardiner.