Clasificación para el Campeonato Africano de Naciones de 2016

Al estar automáticamente clasificada por ser el país anfitrión la selección de Ruanda no participó en el torneo clasificatorio.

La CAF descalificó a la selección de Argelia como consecuencia de su retiro del torneo clasificatorio para la CHAN 2014 que se desarrolló en Sudáfrica,[1]​ las 10 selecciones restantes que no participaron no llegaron a inscribirse.

En la Zona sur los 12 equipos participantes forman 6 series para competir en la ronda preliminar, los 6 ganadores clasifican a la primera ronda en la que forman tres series, los ganadores obtienen los tres cupos de clasificación disponibles en esta zona.

En caso de persistir el empate se define al ganador directamente mediante tiros desde el punto penal, sin jugar tiempos extras.

Mtonga Zimba Chirwa Phiri Mfune Chepeshi Kalengo Isaacks Tjetjinda Kamatuka Keimuine Gebhardt Iimbondi Hoaseb

Situación de los países respecto a la clasificación.
Clasificado.
Eliminado.
Descalificado, retirado o no participó. No pertenece a la CAF.